bioinformática : 1. f. Biol. Aplicación de las técnicas informáticas al estudio de la información genética (Diccionario de la RAE Vigésimo Tercera Edición)

La cantidad de recursos informáticos disponibles en la web relacionados con el campo de la bioinformática es tan amplia que puede ocurrir que en lugar de ser algo positivo, se transforme en objeto de distracción y confusión.

biolansys.com trata de recopilar una selección de dichos recursos organizándolos por áreas, además de aportar aplicaciones propias bajo la política de freeware u open source.

En la sección superior derecha de esta página se pueden hacer búsquedas mediante un portal general (web ) , otro con acceso a portales de búsqueda específicos para bioinformática (bio ) y otro para búsquedas en twitter (twitter).

En la pestaña SMS2 se accesa la página de Sequence Manipulation Suite versión 2. Está página incluye una gran cantidad de herramientas de bioinformática desarrolladas en javascript.

En la pestaña GLmol está disponible el visor 3D de moléculas GLmol, que permite visualizar moléculas de los servidores PubChem y RCSB PDB, archivos del usuario en formato pdb o copiar en la ventana de texto la definición de la molécula. El navegador a utilizar debe ser compatible con WebGL.

En la pestaña YABS se accesa una biosuite muy básica que permite entre otras funcionalidaes utilizar algunas de las opciones de la nueva Ensembl REST API . Esta API tiene por objeto consultar la base de datos Ensembl mediante recursos web, sin utilizar la API tradicional en PERL. Adicionalmente hay implementaciones de accesos a TogoWS REST y BLAST REST.

En la pestaña biophp se incluye una versión ligeramente modificada del set de programas minitools/biophp

Recomendaciones
  • Si utilizas firefox instala la barra auxiliar biobar
  • Para realizar alineamientos de múltiples secuencias y generación de árboles filogenéticos en modo local, descargar biolansys.zip o BioAlignGUI.zip
  • Para realizar alineamientos de múltiples secuencias en la web utilizar los recursos de la pestaña Portales : Online Align
  • Para realizar búsquedas de secuencias en la web :
    • Utilizar los recursos de la pestaña Portales : Online Search
    • Utilizar la barra de firefox biobar
    • Utilizar la opción bio search en la cabecera de esta página .
  • Para operaciones sobre secuencias en la web utilizar las pestañas SMS2 y biophp
  • En la pestaña Enlaces : Linux hay referencias a versiones de linux orientadas a bioinformática. Estas versiones pueden ejecutarse desde un Pendrive, DVD o en una máquina virtual (VirtualBox,Qemu) sin necesidad de instalarse en un PC.
  • Parece elemental, pero es importante mencionarlo : aprender inglés .