gffGUI es una interfase gráfica freeware disponible para plataforma windows que permite extraer información de un archivo en formato gff

Las opciones disponibles son:
  • Extraer la sección FASTA
  • Extraer anotaciones de un tipo determinado (genes, exones, intrones, CDS, etc)
  • Extraer anotaciones en un rango determinado de coordenadas
  • Convertir el archivo a otro formato

En la sección de visualizacion de texto (región derecha) tenemos disponible un menú (boton derecho) con las siguientes funciones:
  • Guardar como ...
  • AliView : Visualizar la sección FASTA
  • Editor : Visualizar el texto en un editor externo
  • Table: Visualizar las anotaciones visualizadas en formato de tabla

En el directorio gff se incluye un archivo de ejemplo con el genoma de la levadura.



Descargar gffGUI.zip y descomprimir en cualquier directorio, a continuación ejecutar el archivo gffGUI.exe