gffGUI es una interfase gráfica freeware disponible para plataforma windows que
permite extraer información de un archivo en formato gff
Las opciones disponibles son:
- Extraer la sección FASTA
- Extraer anotaciones de un tipo determinado (genes, exones, intrones, CDS, etc)
- Extraer anotaciones en un rango determinado de coordenadas
- Convertir el archivo a otro formato
En la sección de visualizacion de texto (región derecha) tenemos disponible un menú (boton derecho)
con las siguientes funciones:
- Guardar como ...
- AliView : Visualizar la sección FASTA
- Editor : Visualizar el texto en un editor externo
- Table: Visualizar las anotaciones visualizadas en formato de tabla
En el directorio gff se incluye un archivo de ejemplo con el genoma de la levadura.
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Descargar gffGUI.zip y
descomprimir en cualquier directorio, a continuación ejecutar el archivo gffGUI.exe
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